平凡な町で、家族5人で暮らす普通の小学生、高町なのは（CV：田村ゆかり）は、友達の月村涼花（CV：清水愛）、エリッサ・バーンズ（CV：釘宮理恵）らとのんびり暮らしていた。 . 人生を考える。この日、偶然発見したのはミンクに似た動物のユノ・スクレリア（水橋かおり）。負傷したユノはなのはたちに救出されるが、街には次々と様々な魔物が出現。ユノの助けにより、なのははライジングハートで魔法少女に変身し、襲来するモンスターを倒し、エネルギーの結晶ジュエルシードの秘密と自分の使命を知る。それから数日、彼女は魔法少女の資格を得るために、友達に隠れて練習を始めた。その夜、突如現れた謎の魔法少女フィット・テステロッサ（CV：水樹奈々）により、なのはと激しい戦いが始まった。二人の長年にわたる関係が始まる…。