近い将来、「メデューサ」として知られる後天性細胞硬化症症候群（ACIS）が世界中に蔓延し、感染者は30～60日の潜伏期間を経て発症し、わずか12日で死亡する。死んだ時は全身が石と化し、その姿は恐ろしいものでした。特効薬も対策もなく、終末的パニックに陥った人類世界。この時、科学研究開発会社ビーナスゲートは、冷凍睡眠によって人間の生命の希望を保つことができると発表しましたが、冷凍カプセルを使用できる資格を持つ人は世界でわずか160人だけです。少女イーセクシア（CV：花澤コリアンダー）は、幸運にもその160人の一員に選ばれたものの、愛する双子の姉妹との別れを余儀なくされる。シャオシアが再び目を覚ましたとき、彼女はゲート・オブ・ヴィーナスの本部で奇妙な光景を発見しました。そして、奇妙な生き物のグループがこれらの人々を攻撃しました。シャオシアを待ち受ける過酷な運命とは… 本作は、岩原裕二原作の同名コミックを映画化したもの。