時代は大正末期。日本は軍事国として世界と戦わなければならなかった激烈な時代。主人公・柊京一郎は帝大に合格し、帝都へ向かう。京一郎は学業に励んで故郷の名士になろうと決意するが、その特殊な能力のせいで大日本帝国陸軍の司令部から注目されてしまう。死んだ人間の魂が見えるようになったのは、京一郎が幼い頃に大病を患ったことがきっかけだった。それ以来、アンデッドは京一郎にとって恐怖の対象であり、軍は外国の脅威に対抗するための戦力としてアンデッドを利用してきた。軍部とその計画を阻止しようとする者達との対立は京一郎の運命を左右し、帝国の未来を変える。