地球の宇宙基地は一連の謎の信号を捕捉し、その信号は宇宙の他の文明から来たものであると考えています。地球外文明を探索するために、船長「ユアン」は星間宇宙船ディープ・スペースを操縦し、93人の乗組員と知能ロボット「チー」を率いて宇宙へ出航し、星への旅に乗り出した。しかしそれから間もなく、宇宙船は謎の失踪を遂げた。 150年後、ディープ・スペース宇宙船が地球の軌道付近に突如現れ、船内に生き残っていたのは船長の元々の恋人「イン」だった。人類宇宙局はインを調査・尋問するための臨時委員会を設置し、「ディープ・スペース」での恐ろしい体験が徐々に明らかになった。