この映画は、新世代のスパイダーマン マイルズ (声はシャメイク・ムーア) とスパイダーグウェン (声はヘイリー・スタインフェルド) が多元宇宙を旅して、より壮大な冒険に乗り出す物語です。すべてのスパイダーマンが愛する人を失う運命に直面したマイルズは、運命の呪いを打ち破り、ヒーローとしての道を見つけることを誓った。この決定により、スパイダーマン 2099 (声: オスカー アイザック) 率いるスパイダー アライアンスとの間に大きな対立が生じました。1 対 100 のスパイダーマン内戦が始まろうとしています。