捜査官イーサン・ハント（トム・クルーズ）とIMFチームは、全人類を脅かす新兵器を追跡し、それが悪者の手に渡るのを防ぐという、これまでで最も危険な任務に乗り出す。同時に、イーサンがかつて戦った闇の勢力が復活し、全世界の運命が危険にさらされています。謎の強大な敵を前に、彼は使命か愛かという究極の選択を迫られる。