シーズン3は、麻薬ビジネスのグローバル化に火がついた1990年代を舞台に、フェリス逮捕後に勃発した戦争を描く。独立したばかりの麻薬カルテルが政治的混乱と激化する暴力を生き延びようと奮闘する中、新世代のメキシコ麻薬王が台頭する。しかし、この戦争では、真実は常にとらえどころがなく、あらゆる逮捕、殺人、強盗が真の勝利をますます遠ざけるだけです...