ディメンターの追撃から逃れ、魔法省の審査に合格したハリー（ダニエル・ラドクリフ）は、ついに美しいホグワーツに戻ってきた。しかし、今学期は簡単ではありません。魔法レベルの試験を完了しなければならないだけでなく、夜の悪夢や、闇の魔術に対する防御の教師であるアンブリッジからのプレッシャーにも対処しなければなりません。友人たちの支援を受けて、ハリーは密かにダンブルドア軍団を結成し、みんなで闇の魔術に対する防衛術を練習しました。悪夢の中でハリーは常にヴォルデモートの視点から登場し、両者の間には不思議なつながりがあるようです。ダンブルドア (マイケル・ガンボン) の指示のもと、ハリーはスネイプ教授 (アラン・リックマン) から閉塞術を学びましたが、ほとんど成功しませんでした。最後に、悪夢に誘われて、ハリーはシリウスを救出するために妄想的に魔法省に駆けつけたが、ヴォルデモートの罠にはまって不死鳥の騎士団と死喰い人の正面衝突を引き起こすことは望まなかった。乱戦の中で、シリウス（ゲイリー・オールドマン）は残念ながら死亡した。ハリーとヴォルデモート（レイフ・ファインズ）の間にはどのような関係があるのでしょうか？悲しみの中、ダンブルドアはハリーに謎を明かしました。ハリーにはまだ長くて困難な道が待っています...