西暦2011年、米国フロリダ州。恋人とドライブ中に交通事故を起こした九条徐倫は、はめられ懲役15年の判決を受けた。絶望の淵にあった徐倫は、父から託されたペンダントを手にした時、驚異的な力に目覚めた。徐倫の前に現れる謎の少年、次々と起こる不可解な出来事、訪ねてきた父・空条承太郎から告げられる恐るべき現実、そしてDIOと呼ばれる男…果たして空条徐倫はこの状況から逃れることができるのか？この「石の海」の牢獄から自由を取り戻すには？ジョースター一族とDIOの百年にわたる抗争に終止符を打つ戦いが始まろうとしている。