ニック・フューリー（サミュエル・L・ジャクソン演じる）が地球に帰還し、タロス（ベン・メンデルソーン演じる）とマリア・ヒル（コビー・スマルダーズ演じる）の助けを借りてスクラルの侵略を阻止する物語が語られる。