1999年、デジタルワールドにおけるデータの異常な増殖により、デジタルワールドと現実世界の接続が分断された。そのため、東南アジアでは雨が降らずすべての池が干上がり、中東では豪雨が続いて洪水が発生し、米国は史上最も寒い冬を迎えました。 11歳の少年・八神太一（CV：藤田淑子）と、その仲間である石田ヤマト（CV：風間勇人）、竹内空（CV：水谷優子）、和泉光子（CV：天上有海）、多十川ミミ（CV：天上有海）。声：前田愛）、城戸丈（声：菊池正美）、高石武（声：小西寛子）はサマーキャンプに参加していたが、ひょんなことからカラフルなデジタルワールドに飛ばされてしまう。そこで彼らは「デジモン」と呼ばれるパートナーを得た。デジタルワールドに入った八神太一一行は凶暴な怪物シェルモンに遭遇し、皆が捕まりそうになった時、突如として太一のアグモンがグレイモンに進化して彼らを救った。進化とは一体何なのでしょうか？デジタル世界とは一体何でしょうか？選ばれた子供たちの前に無数の謎が現れ、素晴らしい冒険が始まる…。