アベンジャーズとその後の広範囲にわたるニューヨークの戦いにより、エイリアンと超大国はもはや民間伝承の秘密ではなくなりました。ニューヨークの戦いの後、世界構造は再編されようとしており、キャリア主義者たちは行動を起こす準備ができており、SHIELDは前例のない課題に直面しています。この重大な局面において、かつてニューヨークで死亡したと噂されたエージェントのフィル・コールソン（クラーク・グレッグ）が「復活」し、才能あるグラント・ウォード（ブレット・ダルトン）、メリンダ・メイ（ミン・ナウェン演じる）を吸収した。レオ・フェハッカーベースの市民社会組織「ライジング・タイド」のZ（イアン・デ・ケステッカー）、ジェマ・シモンズ（エリザベス・ヘンストリッジ）、スカイ（クロエ・ベネット）が参加する。彼らは、さまざまな奇妙で疑わしい危険な事件の捜査に死力を尽くして投資しました...