恒星間宇宙船が誤って「スターゲイト・アビス」に閉じ込められ、15人の乗客のうち4人だけが冬眠小屋に入り、生き残るチャンスを得た。貴重な生存ノルマを前に、囚われの異星怪獣を解放し、怪獣を操って虐殺を試みる者もいれば、より多くの人々を救うために自らの命を犠牲にして怪獣に必死に抵抗する者もいる。暗黒の深淵で、正義の戦いが始まる。