謎の現象により全人類が一瞬にして石化されてから数千年が経ち、超人的な頭脳と天性の才能を持つ科学少年・千空が目覚めた。文明が滅んだストーンワールド（STONEWORLD）で、キアンゾラは科学の力で世界を元に戻すことを決意する。同時に目覚めた仲間たちは、並外れた身体能力を持つ幼馴染の大樹を筆頭に、石器時代から現代文明まで、ゼロから文明を創り上げていくことになる。 200万年のギャップ！前代未聞の創造冒険物語がここに始まる！