CW版は1990年のフランス映画『ニキータ』、1993年のアメリカ版リメイク映画『ニキータ：ネバー・ゴー・バック』、およびアメリカとカナダが共同制作した1997年のテレビシリーズ『ニキータ』をベースにしている。マギー・Q演じるニキータは、店強盗中に逮捕に抵抗した際に誤って警察官を殺害したため、女子刑務所に送られた。彼は後に「ディビジョン」というコード名を持つ政府の秘密組織によって救出された。組織はニキータの死亡診断書を偽造し、彼女に新しい人生を始める機会を与え、彼女をスパイとして一流の殺し屋として訓練し、国への忠誠心を育てた。しかし恋人を組織に殺された彼女は真実を見て組織から逃走。 3年間の潜伏を経て再び姿を現した彼女は、何としてでも組織の陰謀と秘密を暴くことを決意した。一方、彼女はアレックス（リンジー・フォンセカ）に組織内で潜入捜査官として働くよう手配した。そしてマイケル（シェーン・ウェスト）はニキータを追うチームのリーダーだが、ニキータに同情的な感情を抱いていた…。