マーゴ (声: ミランダ・コスグローブ)、イーディス (声: ダナ・ゲイアー)、アグネス (声: エルシー・フィッシャー) の 3 人の愛らしい少女たちとの運命を悟って以来、かつての悪者グルー (声: スティーヴ・カレル) は、ある出会いの後、完全に手を洗った彼は、不味いプリンを作るのが得意な優しい父親に変身した。もちろん、完璧なものなど何もありません。この間、大悪人の伝説的な人生に憧れていた昔のパートナー、ナファリオ博士（声：ラッセル・ブランド）は彼のもとを去り、別の仕事を見つけました。ある日、グルーは有能だが無謀なエージェントであるルーシー・ワイルド（クリステン・ウィグの声）に誘拐された。ルーシーのグループが生物学的遺伝子を変えることができる薬を開発していたことが判明したが、南極の部屋での実験は謎の人物によって盗まれた。泥棒だったため、悪役経験のあるグルーに潜入捜査官を任せた。しばらく考えた後、グルーはその仕事を引き受け、とてもかわいい手下たちとともに、ルーシーと陽気な殺人猟団パートナーを結成しました...