2016年、変人「バグスター」＝正体不明により、未知のコンピューターゲームウイルスが世界に侵入し始めた。感染者を救うため、天才プレイヤー・永夢星はバグスターと戦うことを決意し、仮面ライダーエグゼイドに変身する。