中国主導の国際科学研究プロジェクトがマリアナ海溝の深部で未知の生物に襲われ、研究者たちは海底に閉じ込められた。元アメリカ海兵隊の深海潜水専門家、ジョナス・テイラーは救助に向かうよう命じられ、数年前に深海で消えない記憶を残した先史時代の生物、メガロドンに再び遭遇した。ジョナスは科学研究プロジェクトの中国人女性科学者、張素音と協力し、閉じ込められた人々の救出に成功するが、救出作戦で誤ってメガロドンが深海から逃げ出してしまう。先史時代の巨人が浅い海に戻ったとき、人類は自然への貪欲さのために大きな代償を払うことになるでしょう...