この番組は、「LOST」のプロデューサーデュオであるJ.J.エイブラムスとブライアン・バークによって制作されています。シーズン 2 のストーリーはシーズン 1 に続きます。フィンチ (マイケル・エマーソン) が謎のミス・ルートに誘拐された後、「スーツマン」ジョン・リース (ジェームズ・カヴィーゼル) は友人の探偵カーターの助けを借りて、ニューヨークでフィンチを頼らなければなりませんでした。警察殺人課のタラジ・P・ヘンソンとファスコ（ケビン・チャップマン）の慎重な捜査により、フィンチは最終的に救出されたが、ルート・エスケープによって殺害された。日常が戻ってきたように見えますが、実は危機が隠れています。フィンチのプログラムを公にしたいと考えているルートに加えて、人事部の背後にいる本当の人物を突き止める必要もあります。一方、FBIとCIAはジョンの捜索に努力を惜しまない。機械が存在する限り、この街は彼らを休ませてくれないらしい…。