「ソニック・ザ・ヘッジホッグ」は、セガが制作した世界的に人気のあるビデオゲームを原作としています。ソニック (ベン・シュワルツの声) は、もともと自分の惑星で幸せに暮らしていた青いハリネズミです。しかし、悪の勢力はソニックの超スピードを欲しがり、このユニークなスキルを奪おうとします。ソニックを守るために、心優しいフクロウの養母はソニックに安全な惑星にテレポートできる魔法の指輪を与えました。こうしてソニックは地球にやって来て、モンタナ州グリーンマウンテンシティに着陸した。最初、ソニックはここでとても快適に暮らし、友達のグループを作りました。政府がソニックの存在を発見すると、すべてが複雑になります。政府は悪の科学者エッグヘッド博士（ジム・キャリー演じる）を派遣し、ソニックを捕まえて恐ろしい科学研究を行うよう命じた。ドクター・エッグマンの追跡を回避するために、ソニックと保安官トム（ジェームス・マースデン演じる）はサンフランシスコに行き、そこで紛失した魔法のリングを手に入れなければなりません。