時は戦国時代。大御所の領主景光は、とある寺院のロビーにある12体の神仏に領地の繁栄を願いました。引き換えに生まれた景光の子孫は体のあちこちに欠陥があり、不遇児とみなされ川に捨てられた。時が経ち、幽霊と神々は景光との協定を履行し、国は平和を迎えました。ある日、盗賊の青年「どろろ」は一人の男と出会った。それは幽霊か人間か? 両腕に剣を持ち、義体を持った男「百鬼丸」が、迫り来る鬼を光のない瞳で見つめる。