ある晴れた日、東都スタジアムでは江戸川コナン（声：高山みなみ）、灰原哀（声：林原えみ）、阿笠博士と少年探偵団の面々が、東京スピリット対ガンバ大阪の素晴らしいサッカー試合を繰り広げていた。友達が応援に来てくれました。街の反対側、事務所にいる真織小五郎（声：大山力）のもとにテロ事件の連絡が入る。シャオラン（声：山崎と佳奈）は、懸命の努力の末、ついに新一を追い出し、囚人が残した秘密の暗号を解いて、数え切れないほどの命を救うことに成功した。その後、警察とマオリ党は複数の容疑者を特定し捜査を開始した。一方、闇に潜む囚人たちは新たな襲撃を画策し続け、前例のない挑戦、時間との闘い、そして無数の恨みを込めた襲撃を 本作は創立20周年記念作品である。日本のJリーグの現役選手、三浦知宏選手、遠藤保仁選手、今野泰幸選手、楢崎真砂選手、中村紀剛選手らが映画の中で自身のキャラクターの声を担当した。