突如地球に襲来した宇宙帝国「残酷」の艦隊は、愛と夢、平和と人類の笑顔を守るため、34のスーパーチームが集結し、その凶悪を撃退することに成功するが、その力も消滅した。時は流れ、ブルータルは再び地球に侵入した。この時、最大の宝を求めて地球にやって来た5人の宇宙海賊が、残虐行為に反対する旗を掲げた。それがパイレーツチーム・ゴクアイジだ！