西暦1999年、未知の巨大な「隕石」が地球に衝突した。その後の調査により、これが実際には異星人の宇宙船であることが確認されました。その後、それを修理し、墜落時に地球環境に与えた損害を補うために、世界のいくつかの強国は異星人の宇宙船が墜落したという事実を隠蔽しなければなりませんでした。 . 統一政府が樹立された。それは地球連合軍によって全長1,200メートルの超大型戦艦に改造され、「マクロス」（ドイツ語で「大宇宙」の意味）と名付けられた。この期間中、人類はまた、労働組合主義者と反労働組合主義者の国民陣営の分裂を経験し、マクロトの改革は継続的な戦いの中で継続した。それから10年後、マルクロスの正式打ち上げ式の日に、月周回軌道付近で大規模な時空ジャンプ反応が突如発見された。この時、マーク・ロス船の主砲が自動発砲し、月面に現れた異星艦隊観測船に命中した！ここまで来ると、急に相手を刺激しないのはおかしい……ということで、連合軍は戦闘を開始し、敵の進路を逸らすためにマクロスを離陸させて出航させるしかなかった。注意。青年一木は誤って連合軍の戦闘機に乗り込み、戦闘に巻き込まれ、リン・ミンメイという少女を救出し、以前から顔見知りだった船の女性士官ウェイシャとも喧嘩することはなかった…。これは人類と異星人との戦争「第二次世界大戦」の始まりです。ホイ、ミンメイ、ウェイシャを巡る感情のもつれも戦争の展開に介入し始め、その後の歴史の流れを左右するきっかけにもなった…。