3,000万年前、闇が世界を恐怖に陥れました。最後は光の巨人が闇を遥かな宇宙に封印した。光の巨人も頑張って赤い惑星で長い眠りについた。時は流れ、地球平和同盟TPUが急遽エリート集団「GUTS-SELECT」を結成した頃、主人公・真中健吾は新興火星で植物学者として平和に暮らしていた。しかしある日突然、超古代の封印の闇が再び襲来し、安定した平穏な生活が崩れ去った。火星の街が怪物によって破壊されたとき、ケンウーは運命に導かれ、眠れる光の巨人と出会う。この出会いは彼と地球にどんな影響を与えるのでしょうか？時空を超えて目覚めた光の巨人、その名はウルトラマントリガ。