超大型巨人が出現し、人類の平和と幻想が打ち砕かれたあの日から、エレン・イェーガーの終わりなき戦いの日々は止まらなかった…。抵抗する力を失ったエレンは、巨人の餌食となる母を見て、この世から全ての巨人を駆逐することを誓う。しかし、その激戦のさなか、彼自身も巨人の姿に変貌してしまう――。人類の自由を取り戻すため、巨人の力を利用するエレンはウォール・シーナのストヘス区にて「女型の巨人」と対峙する。この巨人同士の熾烈な戦いは、アレンが苦労して勝利した。それでもエレンと人類に休む暇はない。次の戦いはすでに始まっています。薔薇の壁に迫る巨人の大群を前に、人類はどう立ち向かうのか？ ?