かつて、世界の平和を守り、巨大なモンスターや異星人の侵略の脅威と戦う役割を担った「光の巨人」がいました。彼はウルトラマンモバイルだ。任務中に科学探査隊員の早田進と一度接触し、任務終了後に地球を去った。今日、人類は繁栄の時代を迎えたが、それは幻想の平和に過ぎなかった…今、世界は再び“光の巨人”の力を必要としている。この時、光の遺伝子を受け継ぐ新たな英雄が現れた。しかし、彼は背が高くなく、中肉中背で、金属製の制服を着た感傷的な高校生です。彼の名前は早田進次郎、初代機動ウルトラマン早田進次郎の息子です。早田進次郎が様々な困難を乗り越え新世代の機動ウルトラマンとなり、新たな物語が展開する。