物語の舞台は遠い未来、平凡な少女ジュピター・ジョーンズ（ミラ・クニス）は幼い頃に父親を亡くし、広大な人々の中でトイレ清掃員として懸命に生きています。ある日、何の前触れもなく、宇宙からやって来た賞金稼ぎの“オーク”ケイン（チャニング・テイタム）によってジュピターの運命は一変するが、これはすべてジュピターとは何の関係もない謎の遺伝子に関係している。持って生まれています。広大な宇宙の最深部には、数千億年にわたって続いたエブラシケス王朝があると言われており、先代女王の死後、バーハム（エディ・レッドメイン）が初代後継者となった。 Jian Zuo 著）は、野心的に邪悪な計画を開始しました。しかし、ジュピターは前女王に最も近い血統を持っており、バルハムの王位にとって脅威となっている。本来少女を殺害した張本人であるケインは、砲撃の中ジュピターとともに走るうちに徐々に心変わりしていく…。