宇宙に散らばった人形のように、彼らは流星となって地球に降り立った…時は流れ、現代。運命に選ばれた少年、光講堂は驚異の「ギャラクシー・スパーク」を手に入れた。小さくなった怪獣やウルトラ戦士たちは、謎の物体によって再び元の巨大な姿に戻った。それと同時に、凶悪な怪物や宇宙人が突如現れた！巨大な闇の力が急増し始めました。ヒカルは人類を守るため、ギャラクシースパークの力で怪獣やウルトラ戦士の人形たちを「ウルトラ」に統合する。そして新たなウルトラマン登場！