最愛の女性を失ったボン（マット・デイモン演じる）はさらに困難な日々に直面し、思い出そうとするが、睡眠中に半ば理解できなかったフラッシュバックによって目覚めることができ、依然として自分の身元を思い出せない。しかし、ボンは一般人になる運命にありません。彼が落ち着いて自分の正体を「見つける」前に、CIA から送り込まれた殺人者が次々とやって来ます。いくつかの連続した戦闘の後、ジェイソン・ボーンはついに完全にイライラし、反撃することを決意しました。彼は率先して殺人者を追跡し、モスクワとマドリッドに旅行しました。パリのほか、ロンドンとタンジールにも立ち寄りました。問題が 1 つずつ解決されるにつれて、ジェイソンはニューヨークに戻り、そこですべての答えを見つけ、自分のアイデンティティを取り戻すことになります。