時は1968年、学生運動が激化していた頃、とある大学の医学部に奇妙な男が現れた。黒と白の髪、体中に傷があり、傷だらけの顔は登録商標になっています。医師資格取得を目指して勉強していた男の名はマグロ、その天才的な能力で数々の奇跡を起こした。そして後世からはブラック・ジャックと呼ばれるようになりました。