女だけが扱える世界最強の兵器「インフィニット・ストラトス（IS）」を中心に、女尊男卑の世界で、主人公でありながらISを操ることができる主人公「折原一花」。そのため、ISを制御するための訓練所に入ることになった主人公の学校「IS学園」は当然女子だらけで、女子たちもこの「世界で唯一ISを使える男」に興味を持っている。 、そしてたくさんの興味深い学校生活が始まります。