『隣人同棲2』のストーリーでは、上白石萌音演じるシャオクイは、親友のシャオメンと離れ離れになりたくないために、両親と一緒に引っ越しず、外で一人で暮らすことを選択しました。シャオメンが学校の魅力的な王子様・柊セージ（杉野遥香）に告白し、すぐにフラれたが、実は柊セージはシャオクイの家の隣に引っ越してきた。しかし、柊を嫌うシャオクイは、ひょんなことから彼の多面性を知り、彼への気持ちが少しずつ変化していく。二人はまた、突然の事故をきっかけに同居生活を始めることになる。さらに、柊のいとこ・麗音（横浜流星）も加わり、三角関係はどうなっていくのか？