科学技術の発展に伴い、人類は人の脳波を検出できる「賢い」ロボット「預言者」を発明しました。 「預言者」は人の犯罪意図を察知することができるため、犯罪者が犯罪を犯す前に犯罪防止組織の警察に逮捕され、刑罰を受けている。ジョン (トム・クルーズ) は犯罪防止組織のディレクターです。 「預言者」によって不倫による二重殺人事件を阻止することに成功したジョンは、この完全犯罪防止システム、すなわちマイノリティ・リポートに隠された秘密を薄々感じていた。人が殺人未遂をしたかどうかを判断するために協力する3人の「預言者」がいることが判明しました。意見の相違が生じた場合には多数決に基づいて決定されますが、少数派側が正しいと証明された場合には少数派の報告書は秘密に保管されます。ジョンが目を覚ますと、突然、自分が元同僚たちによって逮捕の標的になっていることに気づきました。ジョンの唯一の方法は、彼の無実を証明する少数派の報告書を見つけることです...