女子高生の朝霧彩は、学校では毎日クラスメイトにいじめられ、家では兄に虐待され、精神的に崩壊しそうになったとき、偶然「魔法少女サイト」に入り、魔法の称号を手に入れた。その杖には不思議な力があり、ある日、クラスメイトにいじめられていたカイがその杖の力を使ってしまった後、彼女の目の前から突然クラスメイトが現れ、遠く離れた場所でそのクラスメイトは無残に死んでしまった。この魔法少女の杖の能力は永久に使用することができず、一度使用すると魔法少女の手の紋章が完全に消えると魔法少女は死亡してしまう。物語の設定上、魔法少女サイトは全部で18あり、サイト管理者も18人いるということは、少なくとも18人の魔法少女が存在することになるが、ヒロインであるマドンナは属性が多く罪悪感を持っている。彼女は誤ってクラスメートを殺してしまい、他の魔法少女が杖を奪おうとしており、それが魔法少女同士の戦いにつながる。