米国の原子力潜水艦モンタナは、深海で未確認物体を追跡中、残念ながら行方不明になりました。高圧潜水装置ハート・オブ・ザ・シーの所長バド（エド・ハリス）は、コフィー船長（マイケル・ビーン）と協力するよう命令を受けました。マイケル・ビーン）が救助に向かった。予想外だったのは、バドと対立していた石油会社のエンジニアである妻のリンシー（メアリー・エリザベス・マストラントニオ）も同行するということだ。 3人の救助隊は潜水艦が消えた奈落の縁まで潜ったが、潜水艦には誰も生き残っていなかった。恐ろしいのは、その深淵には未知の怪物がいることだった。一連の危機の後、コフィー船長は説得を拒否し、これはソ連の陰謀であると判断し、潜水艦から取り出した核爆弾を未知の敵に向けて発射することを決意した。危機の瞬間、バードは危険を顧みずリンシーを救出し、核弾頭の信管を外すために深淵に潜った。任務を終えたバードの酸素は尽き、その瞬間、深海の怪物が再び現れた。