宇宙世紀0068年、サイド3に住んでいたムゾー自治共和国の議長が「完全独立宣言」を発した後に急逝したことをきっかけに、一連の混乱が起こり、多くの人々の運命も根本的に変わった。瞬く間に宇宙世紀0074年、エドワード・マーズ（CV：池田秀一）はシャア・アズナブとしてジオン自治共和国の国防士官学校に入学する。そこでSIDE3の名弟子ジェルマ（柿原徹也）とは互いに憧れ、疑似友達となる。宇宙世紀0077年、学生たちが立ち上がり、地球連邦軍に対して武装蜂起した。夏雅の復讐も始まる…。