東京都千代田区にある伝統ある高校・音乃木坂学院は、入学者数の激減により廃校の危機に瀕している。 3人は、アイドルになれば学校の評判も上がり、入学者数も増えるという妙案を思いついた。こうして個性豊かな9人の少女たちは、アイドルの名声を利用して生徒を増やし、大好きなキャンパスを守るため、力を合わせてアイドルになることを決意する。