ある時期、日本では文芸書がすべて黒く染まるという奇妙な現象が起きた。これは、本に登場する負の感情を持って生まれた「侵食者」によって引き起こされた災害です。侵食された文学書は人々の記憶から徐々に消え去り、最終的には最初から存在しなかったかのようになります。そこで、本の世界を滅ぼした「侵食者」と戦い、文学を守るため、特殊な能力を持つ「錬金術師」が秘密諜報員として図書館に派遣され、転生作家たちと戦った。