2015年、魔法最後の時代。人材継続保護機関「カルデア」は、近未来観測鏡「シバ」を通して突如、翌2016年に人類が滅亡しようとしていることを知る。時空のビジョンと特別なコードを分析して干渉するために、彼らは総称して「グランドオーダー」として知られるタブーの儀式を使用して、魔術師を精霊の息子に変えて過去に送り返しました。人類の歴史の。冬木の聖杯戦争は歪み、セイバー（アルトリア・ペンドラゴン）はキャスター以外のサーヴァントを全滅させ、大空洞でキャスターの到着を待った。この戦争のキャスターはクー・フーリンで、ランサーなら黒のセイバーを瞬殺できると言っていたが、主人公であるマシューとオルガ・マリーの介入により、この狂気の聖杯戦争は無事に阻止された。セイバー キャスターとキャスターの消滅により、この戦争では誰も聖杯を手に入れることができなかった。レベルの最後でオルガマリーの魂を破壊したレフと、この戦争でセイバーもグランドオーダーを知っているので…？