物語の舞台となるのは、人類の過失と不注意によって海の制御を失い、「深海漂流者」と呼ばれる勢力が存在した世界。力。その勢力に対抗すべく、艦娘と呼ばれる少女たちが現れ、その身に艦の魂が宿り、様々な艦艇の化身として人類の平和のために奮闘する。艦娘達は平日は「ガーディアンパレス」と呼ばれるベースキャンプで日常生活や訓練を行っていたが、ある日みんなの前に、野心に溢れた活発な少女・吹雪（CV：上坂すみれ）が現れる。興奮と興奮に満ちた毎日が繰り広げられる船団の新しい生活に、私は熱心に参加しました。