時は2045年、物語の舞台は日本製の宇宙ステーション「安新」。月で生まれた少年「鳥矢」とその幼なじみ「このは」は、移住のため宇宙ステーションでリハビリ中。地球に降り立ったが、彼らは…初めて宇宙へ旅立った地球の子供たち「オーシャン」「ミイナ」「ドクター」とともに、宇宙ステーションと彗星の衝突に巻き込まれる。大人から隔離され、インターネットからも遮断された閉鎖空間で、時に衝突し、時に助け合いながら、減圧や船外活動（宇宙遊泳）、マイクロマシンの制御不能など、さまざまな困難に子どもたちは共に立ち向かう。